شناسایی چندین توالی های کدکننده پروتئین فسفولیپاز A2 در غده زهر عقرب همی اسکورپیوس لپتروس با استفاده از RNA-sequencing
|
محمد تقی بیگی نصیری ، فاطمه ثعلبی* |
موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی شعبه جنوب غرب کشور ، fat_sa_2012@yahoo.com |
|
چکیده: (120 مشاهده) |
عقرب Hemoscorpius lepturus کشنده ترین عقرب ایران است و به همین جهت از نظر پزشکی اهمیت زیادی دارد. علائم بالینی ناشی از مسمومیت با زهر عقرب H. lepturus، مانند اثرات سمی نروتوکسیسیتی، سوزشهای پوستی و همچنین برخی از واکنشهای التهابی به فعالیت فسفولیپاز A2 آن نسبت داده شده است. هدف این مطالعه شناسایی و دسته بندی ژن های کدکننده فسفولیپاز A2 در غده زهر عقرب H. lepturus است. به همین منظور در این مطالعه، یک کتابخانه cDNA از غدد سم این عقرب با استفاده از تکنیک توالی یابی RNA ایلومینا تولید شد. توالی های کد کننده PLA2 با استفاده از ابزار اصلی جستجوی تراز محلی (BLAST) و جستجوهای تشابه بین داده های خام غده زهر با توالی های ثبت شده از بندپایان دیگر به ویژه عقرب C. sculpturatus شناسایی و استخراج شدند. این جستجوها منجر به یافتن چندین همولوگ از PLA2 در غدد زهر این عقرب با شباهت توالی به فاکتور فعال کننده پلاکت استیل هیدرولاز (PAFA)، PLA2 های وابسته به کلسیم (cPLA2)، PLA2 های ترشح شونده (sPLA2)، PLA2 های مستقل از کلسیم (iPLA2) و گروه III هترودیمریک فسفولیپاز A2 (hgPLA2) شد. اغلب توالی های یافت شده بیشترین شباهت را با توالی های PLA2 از عقرب های C. sculpturatus و Androctonus crassicauda نشان دادند. این اولین گزارش از شناسایی، دسته بندی و تعیین خصوصیات فیزیکوشیمیایی توالی های PLA2 است که در آن روابط فیلوژنتیکی بین بندپایان مختلف با استفاده از توالی های شناسایی شده بررسی شد.
|
|
واژههای کلیدی: عقرب، Hemoscorpius lepturus، غده زهر، فسفولیپاز A2، کتابخانه cDNA، روابط فیلوژنتیکی |
|
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
مهندسی ژنتیک جانوری دریافت: 1402/5/5 | پذیرش: 1402/7/15 | انتشار: 1402/12/24
|
|
|
|
|
ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|